| Platz | Mannschaft | SP | G | U | V | Tore | Diff. | Pkt. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | VfL Osnabru00fcck | 34 | 21 | 7 | 6 | 56:27 | 29 | 70 |
| 2 | Rot-Weiss Essen | 34 | 18 | 10 | 6 | 72:56 | 16 | 64 |
| 3 | Energie Cottbus | 34 | 18 | 9 | 7 | 66:48 | 18 | 63 |
| 4 | MSV Duisburg | 34 | 18 | 9 | 7 | 62:44 | 18 | 63 |
| 5 | Hansa Rostock | 34 | 16 | 12 | 6 | 62:37 | 25 | 60 |
| 6 | SC Verl | 34 | 16 | 10 | 8 | 74:45 | 29 | 58 |
| 7 | Alemannia Aachen | 34 | 16 | 6 | 12 | 63:54 | 9 | 54 |
| 8 | TSV 1860 Mu00fcnchen | 34 | 14 | 10 | 10 | 49:45 | 4 | 52 |
| 9 | SV Wehen Wiesbaden | 34 | 14 | 7 | 13 | 47:45 | 2 | 49 |
| 10 | SV Waldhof Mannheim | 34 | 14 | 6 | 14 | 55:63 | -8 | 48 |
| 11 | FC Viktoria Ku00f6ln | 34 | 14 | 5 | 15 | 48:47 | 1 | 47 |
| 12 | Jahn Regensburg | 34 | 12 | 7 | 15 | 47:53 | -6 | 43 |
| 13 | VfB Stuttgart II | 34 | 12 | 7 | 15 | 43:56 | -13 | 43 |
| 14 | FC Ingolstadt | 34 | 10 | 10 | 14 | 52:49 | 3 | 40 |
| 15 | TSG Hoffenheim II | 34 | 11 | 7 | 16 | 61:62 | -1 | 40 |
| 16 | 1. FC Saarbru00fccken | 34 | 8 | 14 | 12 | 42:49 | -7 | 38 |
| 17 | SSV Ulm 1846 Fussball | 34 | 9 | 5 | 20 | 44:69 | -25 | 32 |
| 18 | TSV Havelse | 34 | 7 | 8 | 19 | 50:75 | -25 | 29 |
| 19 | Erzgebirge Aue | 34 | 5 | 11 | 18 | 40:63 | -23 | 26 |
| 20 | 1. FC Schweinfurt 05 | 34 | 5 | 4 | 25 | 31:77 | -46 | 19 |
Der Drittliga-Meister und der Tabellenzweite steigen am Ende der Saison direkt in die 2. Liga auf. Das Team auf Platz 3 geht in die Relegation mit dem Drittletzten der 2. Bundesliga und spielt um den Aufstieg. Die Teams auf den letzten vier Plätzen steigen direkt in die Regionalliga ab.
